Mageshima nằm cách Tanegashima 12 km (6,5 nmi) về phía tây. Hòn đảo này có nguồn gốc núi lửa và có diện tích khoảng 8,2 km2[1] với chu vi 16,5 km (10,3 mi).[2].[3] Độ cao cao nhất trên đảo là Takenokoshi, với độ cao 71,7 mét (235 ft) so với mực nước biển.[4]Khí hậu đảo đảo được phân loại là cận nhiệt đới, với mùa mưa từ tháng 5 đến tháng 9.